Cell Rep:研究揭示RNA分子對于胚胎干細胞分化的重要性
胚胎干細胞(ESC)具有自我更新的雙重能力和分化的潛能,而兩者都需要受到嚴格的調節控制。在ESC分化過程中,干細胞會發展為特殊的細胞類型,例如皮膚細胞,神經細胞,肌肉細胞等。雖然我們對ES細胞調控的理解主要在于轉錄和表觀遺傳差異等方面,但我們對轉錄后調控的作用仍知之甚少。

最近,丹麥的一個研究小組發現了由PolyA-tail eXosome Targeting'(PAXT)調控的核RNA水平升高以及Polycomb Repressive Complex 2(PRC2)調控的轉錄之間的關系。研究人員提出,過量的RNA會通過隔離DNA來阻礙PRC2的功能。他們的結果強調了核RNA水平穩態的重要性,并證明了大分子RNA調節染色質相關蛋白的能力。
此前的研究中,Torben Heick Jensen實驗室發現了PAXT并將其表征為銜接子復合體,該復合體將多聚腺苷酸化(pA +)RNA靶向核RNA外泌體以進行衰變。在包括鋅指蛋白ZFC3H1在內的PAXT水平下降之后,細胞就會穩定并積累pA + RNA。這為研究細胞核中過量pA + RNA的作用提供了方法。
有趣的是,在小鼠ESC中使用CRISPR / Cas9去除PAXT的組分“ZFC3H1“后,細胞的分化能力遭到了破壞。高通量測序分析顯示Zfc3h1-/-敲除ES細胞顯示出分化相關RNA的表達增加,而這些表達通常被PRC2復合物沉默。進一步研究表明,由于Zfc3h1-/-KO導致RNA過量結合,PRC2復合物的功能和穩定性受到損害。總之,這突出了通過保持RNA衰變以維持核轉錄組穩定的重要性,以防止由于RNA積累而產生脫靶效應。
這些發現是奧爾胡斯大學分子生物學和遺傳學系的Torben Heick Jensen實驗室與哥本哈根大學生物技術研究與創新中心的Kristian Helin實驗室之間的合作完成的。
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