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蛋白質的N-H鍵活化?

來源:作者:人氣:-發表時間:2016-07-19 10:05:00【
多肽的化學修飾對于藥物 研發、生物材料以及生物分子探針的設計意義重大。但是,大部分針對多肽或者蛋白質的結構修飾都局限于支鏈的改造。我們知道,自然界經過億萬年的進化,能夠 神奇精準的對蛋白質或者肽鏈的某一特定位置進行修飾(如乙酰化、甲基化等),這種看似簡單的操作對于生存卻意義重大,這種微小的結構變化對于穩定蛋白質的 三維結構以及通過選擇性識別蛋白-蛋白相互作用來抑制某些酶的活性。比如細菌通過N-甲基化調控自身產生抗生素,生物體內組蛋白的乙酰化水平與腫瘤的產生息息相關。
目前多肽中氨基的烷基化或者芳基化仍存在很大挑戰。盡管可以用非自然的氨酰-tRNA合成酶來實現非自然肽鏈的合成,但使用N-取代的非天然氨基酸的報道非常有限。固相合成是另一種很好的取代方法,但是一旦涉及到N-烷基取代的氨基酸,往往兼容性就出現問題。而關于肽鏈骨架氨基的直接修飾方法就更少了。基于此,美國萊斯大學的Zachary Ball課題組開發了二價銅催化的肽鏈骨架N-H鍵活化(組氨酸定位基團)。(Histidine-Directed Arylation/Alkenylation of Backbone N–H Bonds Mediated by Copper(II).?J. Am. Chem. Soc.,?2016,?138, 7472-7475, DOI: 10.1021/jacs.6b03390)
Zachary Ball和肽鏈骨架N-H鍵活化 組氨酸定位基團

Zachary Ball課題組開發了二價銅催化的肽鏈骨架N-H鍵活化
首先,作者用短鏈蛋白質促甲狀腺激素釋放激素(TRH,下圖中1)作為模型,在NMM緩沖液中,芳基硼酸化合物2在醋酸銅催化下與1發生N-芳基化得到化合物3。質譜、核磁二維譜及二級質譜確定修飾位點在組氨酸鄰位焦谷氨酸N上(此反應與Chan?Lam偶聯反應類似,但后者需要堿性條件且一般在無水環境中甚至加熱才能實現)。進一步的對照試驗證明組氨酸殘基的存在必不可少,且修飾專一發生在組氨酸前一氨基酸的氨基上。
短鏈蛋白質促甲狀腺激素釋放激素合成N-芳基化得到化合物
短鏈蛋白質促甲狀腺激素釋放激素在醋酸銅催化下合成N-芳基化得到化合物
得到此結果后,作者擴大了肽鏈以及硼酸化合物的多樣性。如下圖所示,Leuprolide(4)是一個與TRH類似N末端為Glp的多肽,對芳基硼酸及烯基硼酸的適應性都非常好。而另一多肽angiotensin I(5)相對比較惰性,但烯基硼酸對此多肽相對于芳基硼酸活性要好很多。另外由于angiotensin I另一H6組氨酸的存在,會有混合產物出現,這也是此方法的一個缺陷(多個組氨酸存在影響定位)。
嘗試了不同長度的多肽后,作者用了蛋白質溶菌酶(lysozyme,~14 kDa)作為底物,并選用三種不同的芳基三氟硼酸鹽(化合物15、16、17)進行14位精氨酸(15位為組氨酸)的定點修飾。化合物15和16修飾的產物可以通過Click Chemistry與coumarin進行熒光顯色,化合物17可以與脫硫生物素pull-down并通過affinity purification,得到的修飾后蛋白質的分子量符合預期(因為只有一個組氨酸所以是單一位點修飾)。
蛋白質溶菌酶作為底物,進行14位精氨酸的定點修飾
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此文關鍵字:Zachary Ball|N-H鍵活化