SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒

來源：作者：人氣：-發(fā)表時間：2025-01-20 12:38:00【大中小】

SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒

SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit

本產(chǎn)品是一步法RT-qPCR檢測新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）Omicron毒株（B.1.1.529）中N區(qū)存在的特征性突變del31-33的試劑盒。del31-33 是指N區(qū)第31~33位中E、R 和 S三個氨基酸缺失的突變。Omicron毒株是在南非首次發(fā)現(xiàn)的變異株，在刺突蛋白中含有30多個突變。它比傳統(tǒng)的變異株具有更高的傳染性，因而被世界衛(wèi)生組織（WHO）列為“關(guān)切變異株”（Variant of Concern；VOC）。

本產(chǎn)品針對的是突變位點少的N區(qū)突變，并非突變位點多的S區(qū)。因此引物探針不會與其他突變位點產(chǎn)生反應(yīng)、干擾測試，即可特異性、高靈敏度檢測Omicron。

經(jīng)證實，本產(chǎn)品不與Alpha變異株、Beta變異株、Gamma變異株產(chǎn)生反應(yīng)，只與Omicron毒株產(chǎn)生特異性反應(yīng)。

SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒【281-37703】

◆試劑盒組成

20 Reactions
RT 酶混合物（20×）	20 μL×1
一步反應(yīng)混合物（2×）	200 μL×1
野生型引物＆探針混合物（Wild Type Primer & Probe Mixture）	10 μL×1
N del31-33突變型引物＆探針混合物（N del31-33 Mutant Type Primer & Probe Mixture）	10 μL×1

◆特點

● 容易判斷

使用突變型和傳統(tǒng)型的引物/探針套裝時，可通過比較Ct值進行判斷

● 一步法RT-qPCR法快速檢測突變

約70 min即可完成

● 使用獨立研發(fā)的引物探針進行高靈敏突變檢測

● 當(dāng)與其他突變體檢測試劑盒組合使用時，所有變異株均可于同一反應(yīng)條件下在1塊96孔板上進行檢測

N501Y、E484K、L452R、E484Q、del247-253、N del31-33試劑盒的所有PCR反應(yīng)條件相同，因此可在1塊96孔板上進行檢測

◆檢測原理

采用TaqMan® 探針的1-step RT-qPCR。

▼使用前
在病毒RNA量多的情況下，使用傳統(tǒng)（非突變）型檢測用的Wild Type Primer / Probe，也能在變異株中觀察到擴增信號。請務(wù)必使用傳統(tǒng)（非突變）型檢測用的Wild Type Primer/Probe 和突變型檢測用的Mutant Type Primer/Probe兩種進行檢測。比較兩種Ct值，若突變型檢測用Mutant Type Primer/Probe的Ct值較小，則判斷該病毒為變異株。

◆實驗案例

變異株檢測的應(yīng)用數(shù)據(jù)

用以下5種新型冠狀病毒株的純化RNA對本試劑盒進行測試：

●　Omicron毒株（B.1.1.529）：TY38-873P1，由日本國立傳染病研究所提供

●　alpha毒株（B.1.1.7）：QHN001，N501Y突變，由日本國立傳染病研究所提供

●　Beta毒株（B.1.351）：TY8-612，N501Y突變，E484K突變，由日本國立傳染病研究所提供

●　gamma毒株（P.1）：TY7-501，N501Y突變，E484K突變，由日本國立傳染病研究所提供

●　傳統(tǒng)毒株（VR-1986HK）：從ATCC購買的熱滅活新型冠狀病毒株

樣本拷貝數(shù)：5000拷貝/孔

循環(huán)數(shù)：45

① Omicron株（B.1.1.529）：TY38-873P1

Omicron毒株在N區(qū)含有del31-33突變，因此N del31-33 Mutant type Primer / Prob的擴增曲線（紅色）比Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍(lán)色）更早起峰。

② alpha株（B.1.1.7）：QHN001

alpha毒株在N區(qū)中不含del31-33突變，因此Wild type Primer / Probe（藍(lán)色）的擴增曲線比 N del31-33 Mutant type Primer / Probe（紅色）的擴增曲線更早起峰。雖然alpha毒株與Omicron毒株均含有N501Y突變，但經(jīng)確認(rèn)本產(chǎn)品不與alpha毒株產(chǎn)生反應(yīng)。

③ Beta株（B.1.351）：TY8-612

Beta毒株在N區(qū)中不含有del31-33突變，因此Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍(lán)色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）更早起峰。雖然Beta毒株與Omicron毒株均含有N501Y突變，但經(jīng)確認(rèn)本產(chǎn)品不與Beta毒株產(chǎn)生反應(yīng)。

④ gamma毒株（P.1）：TY7-501

gamma毒株在N區(qū)中不含del31-33，因此Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍(lán)色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線更早起峰。雖然gamma毒株與Omicron毒株均有N501Y突變，但經(jīng)確認(rèn)本產(chǎn)品不與gamma毒株產(chǎn)生反應(yīng)。

⑤ 傳統(tǒng)毒株（VR-1986HK）：從ATCC購買的熱滅活新型冠狀病毒株

傳統(tǒng)毒株在N區(qū)中不含del31-33突變，因此Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍(lán)色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）更早起峰。

對照RNA的檢測數(shù)據(jù)

使用本試劑盒測定合成Omicron菌株的對照ssRNA。

在不含N del31-33突變的對照ssRNA（Wild Type Control RNA）中，Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍(lán)色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）更早起峰。

在含N del31-33突變的對照ssRNA（N del31-33 Mutant Type Control RNA）中，N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）比Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍(lán)色）更早起峰。

PCR反應(yīng)條件

將板置于qPCR儀板，按以下流程設(shè)定。

◆常規(guī)株以及突變株的基因型

◆變異株一覽表

變異株	N501Y突變	E484K突變	L452R突變	E484Q突變	del247-253突變	N del31-33突變
傳統(tǒng)毒株	－	－	－	－	－	－
Alpha毒株（B.1.1.7）	＋	－	－	－	－	－
Beta毒株（B.1.351）	＋	＋	－	－	－	－
Gamma毒株（P.1）	＋	＋	－	－	－	－
Epsilon毒株（B.1.427/B.1.429）	－	－	＋	－	－	－
Kappa毒株（B.1.617.1）	－	－	＋	＋	－	－
Delta毒株（B.1.617.2）	－	－	＋	－	－	－
Lambda毒株（C.37）	－	－	－	－	＋	－
Omicron毒株（B.1.1.529）	＋	－※	－	－※	－	＋

※含E484A突變

※ 本頁面產(chǎn)品僅供研究用，研究以外不可使用。

產(chǎn)品列表

產(chǎn)品編號	產(chǎn)品名稱	產(chǎn)品規(guī)格
281-37703	SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒	20 Reactions