當前癌癥藥物開發遭質疑新的開發方法或將問世

來源：生物谷作者：人氣：-發表時間：2016-05-06 11:30:00【大中小】

近日，發表在國際雜志Nature Methods上的一項研究論文中，來自范德堡大學的研究人員通過研究指出，用于檢測化合物在細胞中抗癌活性的主要方法或許存在一定缺陷，該研究質疑所有科研單位以及制藥企業開發新型癌癥藥物所采用的方法。

癌癥藥物研發圖片來源于網絡

研究者Vito Quaranta博士表示，有超過90%的癌癥候選藥物在后期的臨床試驗階段宣告失敗，而這些藥物已經花費了數億美元；體外藥物開發標準的缺陷或許并不是唯一應該負責任的因素，但其卻可以幫助尋找對后期影響的估計；文章中研究人員設計了一種新型的標準來評估化合物對細胞增殖的效應，研究者以DIP比率對其命名，即藥物誘導性增殖（drug induced proliferation），這就可以克服傳統方法的缺陷。

30多年以來，科學家們通過將化合物添加到細胞培養液中，并且于72小時候計數存活的細胞數量，以此來評估化合物對細胞的殺傷能力，但這種在單一時間點測定細胞存活數量的“增殖性實驗”并誒有考慮到指數式細胞增殖引入的偏差，甚至是在藥物存在的情況下。研究者Quaranta說道，細胞并不是均一的，但在不同的比率下其就會以指數式進行增長，72小時后有些細胞的數量就會翻三倍，但有些細胞的數量就不會增加。

隨后研究人員將實驗同數學模型相結合開發出了一種新型的系統生物學方法，利用該方法，研究者就可以在靜止的細胞增殖實驗中闡明時間依賴性的偏差度，同時還可以開發不依賴時間的DIP比率標準。研究者表示，我們的方法就是為了尋找統計學上的相關性，從而利用大型的數據庫來作為有效的工具進行癌癥靶點的開發。如果評估細胞對藥物敏感性的標準錯誤了，那么這種統計學相關性也并不成立；隨后研究人員利用開發的新型標準評估了四種不同的黑色素瘤細胞系對藥物維羅非尼（Vemurafenib）的反應，結果在其中一種細胞系中研究者發現在兩種不同的標準中發現了完全不一樣的表現。靜態標準認為，細胞系對維羅非尼非常敏感，然而研究者的分析結果則認為實際上并不是這樣的。

研究者認為，DIP比率可以幫助我們解決很多難題，從而制定出更好的策略，DIP比率標準可以提供另外一種思路，其可以幫助揭示哪種藥物真正具有毒性，而不是簡單的抑制細胞生長，盡管抑制細胞生長的藥物剛開始具有一定的療效，但其往往會使得腫瘤存活從而促進癌癥復發。研究者指出，DIP比率標準同樣也適用于自動化、成像處理等過程。目前他們已經開發出了新型的軟件包，該軟件包可以在文章中的超鏈接中獲取，如今研究者Quaranta正在同范德堡大學技術轉化中心的研究人員進行合作來優化這種軟件包，使其可以更加有效地幫助全球的研究團隊進行藥物的尋找和開發。

文章內容轉載自：An unbiased metric of antiproliferative drug effect in vitro
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