杭師大:miRNA調控水稻葉片衰老
水稻(Oryza sativa L.)生產是保證人類糧食安全的首要任務。提高糧食產量的途徑之一是延緩葉片衰老,并延長光合作用時間。MicroRNAs(miRNAs)是真核生物衰老和細胞衰老的關鍵調節因子。近日杭州師范大學沈波教授的團隊攜手中國水稻研究所莊杰云教授的團隊系統研究了miRNAs在水稻葉片衰老過程中發揮的作用*,研究成果發表在12月刊的PLoS ONE上。
科研人員采用高通量測序技術對兩個不同株系的超級雜交稻(N2Y6,抗衰老稻和LYP9,易衰老稻)葉片構建并測定了6個小RNA文庫,6個DGE文庫,和2個降解組文庫(小RNA測序,DGE測序和降解組測序項目均由聯川生物承擔完成)。 接著基于這些測序數據,對兩個不同品種的雜交稻的miRNA和其靶基因進行深入分析。實驗共鑒定出,372個已知miRNAs,162個候選miRNAs,和1145個miRNA靶基因。相比于LYP9葉片中miRNA的表達,在N2Y6葉片中,在灌漿初期分別有47個和30個miRNAs,在中期分別有21和17個miRNAs,在后期分別有11和37個miRNAs出現上調和下調。鑒定出6個miRNA家族,osa-miR159,osa-miR160,osa-miR164,osa-miR167,osa-miR172和osa-miR1848,分別靶向編碼AP2,鋅指蛋白,水楊酸誘導蛋白19(SIP19),生長素響應因子(ARF)和NAC轉錄因子的基因,發現這些miRNAs可通過植物激素信號轉導通路參與調控葉片衰老。
此項研究成果為理解miRNA介導水稻葉片衰老提供了重要信息,并為水稻育種奠定了重要基礎。
*Xu X,Bai H,Liu C,Chen E,Chen Q,et al. (2014) Genome-Wide Analysis of MicroRNAs and Their Target Genes Related to Leaf Senescence of Rice. PLoS ONE 9(12): e114313.[article]
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