多糖糖基化和糖鏈分析常規問題
FAQs
Q: 如何從糖蛋白中釋放N-多糖糖鏈?
A: 目前普遍采用2種技術用于釋放糖蛋白N-多糖糖鏈用于糖基化分析 - 肼解和內切糖苷酶處理。《糖基化分析指南》涵蓋了一些在選擇這些釋放方法時的注意事項。
Q: 如何制止唾液酸從糖鏈上掉落?
A: 唾液酸是棘手的事情。根據我們的經驗,多糖樣品純度越高,唾液酸殘余就越容易掉落。雖然有些靈敏的預防措施,比如:
- 避免pH酸性和升溫。盡可能保持pH在6-9范圍,溫度低于30°C。
- 在使用離心或旋轉蒸發干燥糖鏈樣品時應小心操作,保持溫度低于25°C。冷凍干燥(凍干)對于防止唾液酸降解更為有效,但存在更大的風險是,在真空放空時,可能導致樣品全部損失。
Q: 對于多糖糖鏈分析而言,較佳的熒光標記是什么?
A: 下表展示了在使用HPLC, CE 和MS進行糖基化分析時,常用的熒光標記:
多糖熒光標記 | 主要應用 | 熒光波長和常規分析方法 |
2-AB (2-氨基苯甲酰胺) |
使用HPLC/MS分析寡糖 | Λex = 320 - 360 nm, Λem = 420 nm HPLC (amide, C18, AEX, HPAE-FD, PGC), ES-MS, MALDI-MS |
2-AA (2-氨基苯甲酸) |
使用HPLC/MS分析寡糖 使用HPLC分析單糖 |
Λex = 320 - 360 nm, Λem = 420 nm Oligosaccharides: HPLC (amide, C18, AEX, PGC), ES-MS, MALDI-MS Monosaccharides: HPLC (C18) |
APTS (8-氨基芘-1,3,6-三磺酸) |
使用CE分析寡糖 | Λex = 455 - 488 nm, Λem = 510 - 520 nm CE |
AA-Ac (3-(乙酰氨基)-6-氨基吖啶) |
使用HPLC分析寡糖 | Λex = 382, 445 nm, Λem = 525 nm HPLC (amide, C18, AEX), ES-MS, MALDI-MS |
DMB (1,2-二氨基-4,5-亞甲二氧基苯) |
使用HPLC分析人以及非人類唾液酸 | Λex = 373 nm, Λem = 448 nm HPLC (C18) |
關鍵詞: AEX = 陰離子交換, HPAE-FD = 強堿性陰離子交換帶熒光檢測, PGC = 多孔石墨烯, HPLD = 高效液相色譜, MS = 質譜 , MALDI = 基質輔助激光解吸附質譜, ES = 電噴霧質譜, CE = 陽離子交換高效液相色譜
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