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microRNA和piRNA研究

來源:作者:人氣:-發(fā)表時間:2014-07-09 14:43:00【

microRNA和piRNA研究

 

AGO蛋白家族

AGO蛋白家族是指與以小分子RNA(small RNA)為介質(zhì)的遺傳基因發(fā)現(xiàn)控制機(jī)構(gòu)有關(guān)的蛋白質(zhì)群。基于氨基酸序列的相似性,AGO蛋白家族又分為AGO亞族與PIWI亞族,已發(fā)現(xiàn)在生殖細(xì)胞、干細(xì)胞(ES、iPS等)中有表達(dá)。
和光純藥公司推出了眾多用于對miRNA和mRNA(存在于細(xì)胞和組織中的RISC的組成成分)進(jìn)行功能分析的工具,這些工具不僅適用于對miRNA的分析,同時也適用于對靶標(biāo)mRNA的分析。
 
 
AGO蛋白家族
AGO亞族 PIWI亞族
AGO1, AGO2, AGO3, AGO4
PIWIL1 / HIWI, PIWIL2 / HILI, PIWIL3, PIWIL4 / HIWI2
AGO1, AGO2, AGO3, AGO4
PIWIL1 / MIWI, PIWIL2 / MILI, PIWIL4 / MIWI2
RNA結(jié)合蛋白
microRNA、siRNA等
piRNA等
 
 

【產(chǎn)品信息】

1. microRNA研究

microRNA(簡稱miRNA)是一種長約22個nt(核苷酸)的內(nèi)源性RNA分子,通過與靶標(biāo)mRNA的互補(bǔ)配對,可抑制mRNA的裂解和翻譯,從 而在動植物體內(nèi)發(fā)揮重要的調(diào)控作用。據(jù)推測,在人體和鼠體內(nèi)存在上千種miRNA,因此對于miRNA的各種研究(例如對功能不明的新型miRNA的鑒定 以及對與特定疾病相關(guān)的miRNA功能的說明等)迅速發(fā)展成為一大研究領(lǐng)域。近來,血清中存在miRNA這一重大事實的發(fā)現(xiàn),開創(chuàng)了利用miRNA作為生 物標(biāo)志物進(jìn)行包括癌癥在內(nèi)的疾病治療的醫(yī)學(xué)未來。一般認(rèn)為,microRNA發(fā)揮作用的方式如下: 先在細(xì)胞中經(jīng)過多個階段發(fā)育成熟,再與蛋白質(zhì)結(jié)合生成蛋白質(zhì)復(fù)合物“RISC”(“RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物”),然后與RISC主要組成部分AGO亞族蛋白 結(jié)合,后再與靶標(biāo)mRNA結(jié)合,從而達(dá)到降解mRNA鏈或抑制翻譯的目的。
人體中存在4種AGO亞族蛋白(hAgo1~hAgo4),可泛表達(dá)基因信息,但表達(dá)水平因類型而異。在AGO亞族蛋白中,只有AGO2具備對靶標(biāo)RNA 裂解的切割酶活性,因此是一種具表達(dá)水平的蛋白質(zhì),可在miRNA合成途徑中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。由于RISC能夠與AGO蛋白抗體發(fā)生免疫沉淀,因此 可從RISC沉淀物中回收miRNA;而且進(jìn)一步研究表明,靶標(biāo)miRNA為共沉淀劑,因此免疫沉淀成法為研究miRNA功能的基本方法。
鑒于上述情況,和光純藥特別推出了眾多對miRNA功能進(jìn)行分析的工具,其中主要為利用抗AGO抗體的miRNA研究工具。通過組合使用上述工具,即可實 現(xiàn)對miRNA和mRNA(存在于細(xì)胞和組織中的RISC的組成成分)的綜合分析— miRNA分析和靶標(biāo)mRNA分析。
 

(1) microRNA純化試劑盒系列:

一種基于利用AGO蛋白抗體的免疫沉淀方法
特性:
  • 1)適用于內(nèi)源性AGO蛋白的免疫沉淀法
  • 2)miRNA與AGO蛋白結(jié)合的純化性能高
  • 3)其他RNA(如rRNA(核糖體)和RNA的降解片段)的污染度低
  • 4)適用于microRNA的高效克隆以及純化microRNA成分的微陣列技術(shù)(測定基因表達(dá)譜的方法和技術(shù))
  • microRNA提取試劑盒,人/鼠AGO1(10次反應(yīng);產(chǎn)品編號:291-70201)
  • microRNA提取試劑盒,人AGO2(10次反應(yīng);產(chǎn)品編號:292-66701)
  • microRNA提取試劑盒,鼠AGO2(10次反應(yīng);產(chǎn)品編號:292-67301)
  • microRNA提取試劑盒,人AGO3(10次反應(yīng);產(chǎn)品編號:297-70301)
 
如果您對上述產(chǎn)品感興趣,請致電400-021-8158了解更多詳細(xì)情況!
 

(2)cDNA編碼microRNA試劑盒的制備

和光純藥microRNA克隆試劑盒可以用于制備cDNA編碼microRNA,只需在microRNA片段制 備后的1.5日之內(nèi)即可完成克隆過程。該試劑盒中含有從蝦中提取的堿性磷酸酶(SAP),能與其中的耐熱性單鏈DNA連接酶(另售)和原改良接頭發(fā)生連接 反應(yīng)。與傳統(tǒng)方法(利用從細(xì)菌中提取的堿性磷酸酶和T4 RNA連接酶)相比,克隆效率顯著提高。
特點:
  • 1) 耐熱性連接酶能夠?qū)崿F(xiàn)接頭的準(zhǔn)確連接,從而提高克隆效率
  • 2) 適用于microRNA克隆以形成二級結(jié)構(gòu)
  • 3) 操作簡單,只需在1.5日之內(nèi)即可生成cDNA編碼microRNA
和光microRNA克隆試劑盒(8次反應(yīng);產(chǎn)品編號:290-66501)
接頭連接高效、準(zhǔn)確、簡捷
耐熱性單鏈DNA連接酶重組體解決方案(200個單位(產(chǎn)品編號:298-65103);500個單位(產(chǎn)品編號:292-65101)
和光靶標(biāo)mRNA克隆試劑盒(10次反應(yīng);產(chǎn)品編號:298-68001)
和光純藥生產(chǎn)的靶標(biāo)mRNA克隆試劑盒用于借助微量mRNA實現(xiàn)cDNA擴(kuò)增,尤其是利用AGO IP RNA片段實現(xiàn)microRNA靶標(biāo)mRNA克隆。擴(kuò)增后的cDNA將成為microRNA的靶標(biāo)mRNA。
特點:
1)方法簡易
2)具備實現(xiàn)微量mRNA擴(kuò)增的性能
3)cDNA擴(kuò)增方式不依賴于mRNA的長度
4)適用于microRNA靶標(biāo)mRNA的研究
和光PCR純化試劑盒(30次反應(yīng)(產(chǎn)品編號:298-67901)
和光純藥生產(chǎn)的PCR純化試劑盒,用于在利用RT-PCR或PCR完成DNA合成后的僅10分鐘內(nèi)去除在各種分子生物學(xué)試驗反應(yīng)緩沖液中形成的引物、引物二聚體、dNTP(三磷酸脫氧核苷酸)以及諸如DNA聚合酶、限制性內(nèi)切酶等多種酶。
THUNDER Taq Gold DNA聚合酶(不含鎂離子的緩沖液) (250個單位;產(chǎn)品編號:317-07081),PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))用耐熱性DNA聚合酶
建議采用THUNDER Taq Gold DNA聚合酶(不含鎂離子的緩沖液)來抑制非特異性擴(kuò)增。THUNDER Taq Gold DNA聚合酶用于PCR的熱啟動,在進(jìn)入PCR循環(huán)前,在95℃的溫度下經(jīng)過10分鐘的熱處理后被活化。由于利用THUNDER Taq Gold DNA聚合酶(不含鎂離子的緩沖液)方式實現(xiàn)擴(kuò)增后的DNA片段是一種腺嘌呤的3'末端, 因此能夠直接插入到T載體中。
 
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(3) 抗體

  • AGO1抗體、單克隆抗體(1F2)
    (50μL(產(chǎn)品編號:018-22401))〈用于蛋白質(zhì)印跡法〉
  • AGO1抗體、單克隆抗體(2A7)
    (50μL(產(chǎn)品編號:015-22411))〈用于免疫沉淀法〉
  • 抗人AGO2抗體、單克隆抗體(4G8)
    (50μL(產(chǎn)品編號:011-22033);100μL(產(chǎn)品編號:015-22031)
    〈用于蛋白質(zhì)印跡法、免疫沉淀法以及免疫細(xì)胞化學(xué)染色法〉
  • 抗小鼠AGO2抗體、單克隆抗體(2D4)
    (50μL(產(chǎn)品編號:014-22023);100μL(產(chǎn)品編號:018-22021)
    〈用于蛋白質(zhì)印跡法、免疫沉淀法以及免疫細(xì)胞化學(xué)染色法〉
  • 抗人AGO3抗體、單克隆抗體(1C12)
    (50μL(產(chǎn)品編號:018-23241))〈用于免疫沉淀法〉
 
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2. piRNA研究

  • PIWIL1抗體、單克隆抗體(2C12)
    (100 μL (產(chǎn)品編號:017-23451))〈用于免疫沉淀法〉
特點:
  • 1) 可免疫沉淀內(nèi)在性PIWIL1蛋白質(zhì)。(5~10µg濃度為10%的蛋白G微珠)
  • 2) 可免疫沉淀PIWI1結(jié)合piRNA。
  • 3) 可在人、鼠的組織和細(xì)胞中使用。
使用例:
 
(1) 小鼠精巢中內(nèi)源性PIWIL1的免疫沉淀(IP)-1
小鼠精巢中內(nèi)源性PIWIL1的免疫沉淀 (IP)-1
Lane 1: NEC14 cells, mouse IgG IP分級 (1/2 vol.)
Lane 2: NEC14 cells, 2C12 IP分級 (1/2 vol.)
Lane 3:小鼠 精巢 IgG IP分級 (1/2 vol.)
Lane 4:小鼠精巢, 2C12 IP分級 (1/2 vol.)

Cell number: 1 x 107 cells
組織(小鼠精巢)重量 25mg
第一抗體(蛋白質(zhì)印跡)
Anti PIWIL1 polyclonal antibody
(gifted from Dr. Miyagawa, Osaka Univ.)
This antibody is not available from Wako.
 
(2) 小鼠精巢中內(nèi)源性PIWIL1的免疫沉淀(IP)-2
小鼠精巢中內(nèi)源性PIWIL1的免疫沉淀 (IP)-2
Lane M:分子量Marker
Lane 1:小鼠IgG IP分級 (1/2 vol.)
Lane 2: 2C12 IP分級 (1/2 vol.)
組織(小鼠精巢)重量 25mg
第一抗體(蛋白質(zhì)印跡)
Anti PIWIL1 polyclonal antibody
(gifted from Dr. Miyagawa, Osaka Univ.)
This antibody is not available from Wako.
 
(3) PIWIL1結(jié)合piRNA的精制
PIWIL1結(jié)合piRNA的精制
Lane M:分子量Marker
Lane 1:小鼠IgG IP RNA 分級 (1/2 vol.)
Lane 2: 2C12 IP RNA 分級 (1/2 vol.)
組織(小鼠精巢)重量 25mg
 
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