蛋白質(zhì)是組成人體一切細(xì)胞、組織的重要成分,但常言道,“過滿則虧,過猶不及”,機體內(nèi)蛋白質(zhì)過量可能會造成大問題,比如增加患癌風(fēng)險,以及讓人們“老”得更快。
當(dāng)?shù)貢r間7月28日,頂級期刊《Nature》發(fā)布了一篇題為Rewiring of the ubiquitinated proteome determines ageing in C. elegans 的研究報告,揭示了蛋白質(zhì)過度積聚與壽命之間的關(guān)聯(lián)。
德國科隆大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),那些更短壽的秀麗隱桿線蟲,隨著年齡的增長往往面臨著蛋白質(zhì)清除功能障礙問題,導(dǎo)致體內(nèi)蛋白質(zhì)的沉積,而如果通過基因治療或化學(xué)藥物加快蛋白質(zhì)的分解,最高可幫助線蟲延長1/5的壽命。
doi.org/10.1038/s41586-021-03781-z
真核細(xì)胞內(nèi)有數(shù)萬種行使各種功能的蛋白質(zhì),其中內(nèi)源性蛋白質(zhì)都有一定的壽命,“到點了”便會被降解。泛素化(Ub)便是引導(dǎo)蛋白質(zhì)降解的途徑之一,能夠給不同類別的蛋白質(zhì)打上“標(biāo)簽”,使其被細(xì)胞內(nèi)相應(yīng)的酶識別并降解。當(dāng)然,該過程是可逆的,能夠被去泛素化酶(DUBs)逆轉(zhuǎn)。
盡管泛素化參與幾乎一切生命活動的調(diào)控,但是目前人們?nèi)圆磺宄撨^程對衰老的影響。因此,研究人員從秀麗隱桿線蟲著手,嘗試探索泛素化與衰老間的潛在關(guān)聯(lián)。
通過將年輕線蟲(誕生5天)與老年線蟲(誕生15天)進(jìn)行比較,研究人員發(fā)現(xiàn),老年線蟲的泛素化普遍減少,并且有350 個 Ub 肽被上調(diào),1,813個Ub 肽被下調(diào),這為衰老與泛素化過程存在關(guān)聯(lián)提供了證據(jù)。
Ub 蛋白質(zhì)組隨年齡增長的重構(gòu)
為了進(jìn)一步評估泛素化的年齡相關(guān)變化,研究人員進(jìn)行了蛋白質(zhì)印跡分析,結(jié)果顯示,與年輕或長壽線蟲相比,老年野生型線蟲表達(dá)更高甚至相當(dāng)?shù)姆核鼐幋a基因,說明泛素化的減少并不是由于泛素表達(dá)的較少或轉(zhuǎn)換率的變化而造成的。
這就很有意思了,難道有一股“神秘力量”,在影響蛋白質(zhì)的泛素化過程?在進(jìn)一步分析中,研究人員終于找到了導(dǎo)致泛素化減少的因素——去泛素化酶(DUB)。在老年野生型線蟲體內(nèi),DUB表達(dá)水平顯著上調(diào),而使用廣譜 DUB 抑制劑 PR-619處理足以挽救低泛素化水平并延長蠕蟲壽命。
抑制DUB挽救了了泛素化過程
盡管蛋白質(zhì)豐度和泛素化水平之間似乎沒有直接的相關(guān)性,但研究人員發(fā)現(xiàn)192 種泛素化程度較低的蛋白質(zhì)在老年線蟲體內(nèi)積聚,并且這種積累是由于下降的泛素化水平阻礙了蛋白酶體對蛋白質(zhì)的識別和降解。
經(jīng)過基因工程改造,研究人員找到了10個年齡相關(guān)的失調(diào)蛋白酶體靶點,分別是IFB-2、EPS-8、RPL-4、M01G12.9、C46C2.2、F54D1.6、DDI-1、LEC-1、HSP-43 和 USP-5。其中,HSP-43 和 USP-5是細(xì)胞活力的重要基因,敲除這兩個基因?qū)е铝巳湎x壽命的縮短,而另外8個基因的敲除則足以延長蠕蟲的壽命。
值得注意的是,IFB-2、EPS-8的敲除對壽命的影響最大,并且單個基因的敲除最高可幫助線蟲延長21%的壽命。IFB-2僅在腸細(xì)胞中特異性表達(dá),該基因的增加可能導(dǎo)致了腸道完整性的喪失;作為細(xì)胞內(nèi)信號通路底物,EPS-8表達(dá)的增加會過度激活RAC通路,造成肌動蛋白過度重塑和聚合,從而影響有機體的壽命、肌肉功能和活動能力。
與年齡相關(guān)的去泛素化破壞了長壽調(diào)節(jié)劑的靶向降解
該研究的領(lǐng)導(dǎo)者、德國科隆大學(xué)分子醫(yī)學(xué)中心的David Vilchez說:“我們的研究結(jié)果帶來了潛在的延緩衰老和提高老年生活質(zhì)量的新方法,尤其是在衰老與泛素修飾蛋白間建立起了聯(lián)系,這將為今后其他研究人員關(guān)于衰老、泛素化和其他細(xì)胞過程的研究帶來重大影響。”
蠕蟲的蛋白質(zhì)清除功能障礙導(dǎo)致組織功能下降
當(dāng)然,仍然存在一些問題有待解決,比如導(dǎo)致DUB隨年齡增加的機制是什么,在小鼠、靈長類動物等更為復(fù)雜的生物中是否也能觀察到泛素化隨年齡增長的這種變化。但總體而言,這項研究揭示了衰老過程中,組織內(nèi)整體去泛素化會影響蛋白質(zhì)的降解從而損害壽命,并揭示了IFB-2、EPS-8是兩個較為突出的抗衰靶標(biāo)。
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