Nature Medicine：COVID-19幸存者一年后血液基因表達(dá)變化

來源：作者：人氣：-發(fā)表時(shí)間：2022-12-28 10:30:00【大中小】

摘要：西奈山醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化與SARS-CoV-2感染急性后遺癥(也稱為“長COVID”)聯(lián)系起來的研究之一，這些患者在因嚴(yán)重COVID-19住院一年多后出現(xiàn)了這種變化。

西奈山的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化與患者因嚴(yán)重COVID-19住院一年多后的“長COVID”聯(lián)系起來的研究之一。長COVID是更專業(yè)地“SARS-CoV-2感染急性后后遺癥”的簡化名稱。

這項(xiàng)研究結(jié)果于12月8日發(fā)表在《Nature Medicine》雜志上，強(qiáng)調(diào)需要在感染階段給予更多關(guān)注，以更好地了解開始然后最終導(dǎo)致長COVID的過程，這可能有助于改善感染后出現(xiàn)持續(xù)癥狀的COVID-19幸存者的預(yù)防策略和治療選擇。

圖1 西奈山醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)表了首批將COVID-19期間血液基因表達(dá)變化（圖源：[1]）

除其他發(fā)現(xiàn)外，研究小組還在免疫系統(tǒng)的抗體產(chǎn)生細(xì)胞漿細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了兩種分子上不同的長COVID癥狀亞群，它們?cè)诩毙訡OVID-19期間具有相反的基因表達(dá)模式。在后來出現(xiàn)肺部問題的患者中，抗體產(chǎn)生基因的含量較低。然而，對(duì)于有其他癥狀的患者，如嗅覺或味覺喪失和睡眠中斷，相同的抗體產(chǎn)生基因反而更豐富。在同一細(xì)胞中觀察到的這些相反的模式，以及在其他細(xì)胞類型中觀察到的其他獨(dú)特模式，表明存在多個(gè)獨(dú)立過程，導(dǎo)致不同的COVID長癥狀;這些過程在急性感染期間已經(jīng)存在。

圖2 研究流程（圖源：[1]）

“我們的研究結(jié)果表明，在COVID-19感染期間，已經(jīng)可以檢測(cè)到導(dǎo)致長COVID的分子過程，”共同通訊作者Noam D. Beckmann博士說，他是西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院查爾斯·布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所的醫(yī)學(xué)助理教授(數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)和數(shù)字醫(yī)學(xué))和數(shù)據(jù)科學(xué)戰(zhàn)略副主任。“此外，我們看到多種分子不同的路徑開始導(dǎo)致長COVID，為長期癥狀之間的差異提供了獨(dú)特的觀點(diǎn)。”

研究人員利用西奈山COVID-19生物樣本庫，檢測(cè)了2020年4月至6月期間因COVID-19住院的500多名患者血液樣本的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。其中160多名患者提供了住院六個(gè)月或更長時(shí)間后仍存在癥狀的自我報(bào)告評(píng)估。研究小組測(cè)試了血液中表達(dá)的每個(gè)基因與每個(gè)長COVID癥狀的相關(guān)性，考慮ICU入院情況、住院期間COVID-19的嚴(yán)重程度、性別、年齡和其他變量。然后，研究小組測(cè)試了13種不同類型的免疫細(xì)胞(包括漿細(xì)胞)的特異性關(guān)聯(lián)。最后，根據(jù)這些關(guān)聯(lián)是否與患者對(duì)病毒特異性抗體水平的變化相匹配來對(duì)其進(jìn)行分類。

圖3 PASC癥狀描述（圖源：[1]）

“對(duì)于長期的COVID癥狀，如嗅覺或味覺問題，將漿細(xì)胞中的抗體基因表達(dá)與對(duì)抗SARS-CoV-2刺突蛋白的實(shí)際抗體水平聯(lián)系起來，表明與身體對(duì)病毒的反應(yīng)有直接聯(lián)系，”查爾斯·布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所的數(shù)據(jù)科學(xué)分析師Ryan C. Thompson博士說。“另一方面，肺部疾病的基因表達(dá)模式與SARS-CoV-2特異性抗體水平不匹配，這凸顯了由COVID-19引發(fā)的導(dǎo)致長COVID的不同免疫過程。”

該團(tuán)隊(duì)表示，長COVID的定義仍然很模糊，未來的研究應(yīng)該考慮到感染的初始階段，以更全面地描述長COVID的分子過程，并確定可以幫助預(yù)測(cè)、治療和預(yù)防長癥狀的生物標(biāo)志物。

“我們的研究結(jié)果表明，有可能使用感染階段的數(shù)據(jù)來預(yù)測(cè)患者幾個(gè)月后可能發(fā)生的情況，”聯(lián)合通訊作者、遺傳學(xué)和基因組科學(xué)副教授、查爾斯·布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所聯(lián)合所長Alexander W. Charney說。“我們不應(yīng)忽視長COVID研究中的感染階段——這顯然是一個(gè)關(guān)鍵的時(shí)間窗口，人體對(duì)SARS-CoV-2的反應(yīng)可能會(huì)為未來的研究奠定基礎(chǔ)。”

參考資料：

[1] Molecular states during acute COVID-19 reveal distinct etiologies of long-term sequelae