摘要:日本理化學研究所生物系統動力學中心(BDR)的研究人員的一項新發現顛覆了幾十年來關于DNA復制的假設。
日本理化學研究所生物系統動力學中心(BDR)的研究人員的一項新發現顛覆了幾十年來關于DNA復制的假設。
Ichiro Hiratani及其同事在8月28日發表在《自然》(Nature)雜志上的實驗表明,早期胚胎的DNA復制與過去的研究結果不同,其中包括一段不穩定時期,這段時期容易出現染色體復制錯誤。由于妊娠失敗和發育障礙通常與染色體異常有關,這一發現可能會影響生殖醫學領域,也許會帶來體外受精(IVF)方法的改進。
圖1 DNA復制定時程序出現時胚胎基因組的不穩定性
在胚胎發生過程中,最初的受精卵分裂,每一組新的子細胞也分裂。到受精后的第三天,胚胎經歷了三次分裂,含有16個細胞。每次細胞分裂都伴隨著DNA復制,確保每個子細胞都包含整個基因組的拷貝。
在RIKEN BDR研究小組的新研究中,研究人員開始描述早期胚胎中DNA復制過程的性質。他們使用自制的單細胞基因組技術,稱為scRepli-seq,并將其應用于發育小鼠胚胎。利用這項技術,該團隊能夠在DNA復制期間的不同時間拍攝單個胚胎細胞DNA的快照。他們的發現與科學家們對胚胎中DNA復制的假設相矛盾。
Hiratani說:“我們在小鼠早期胚胎發育過程中發現了多種特殊類型的DNA復制,這是以前沒有人見過的。此外,我們還發現,在某些時候,基因組DNA會暫時不穩定,染色體畸變會增加。”
教科書告訴我們,DNA 并不是一次性復制完成的。相反,染色體的不同區域會按照特定的順序進行復制。
該團隊的第一個發現是,在成熟細胞中觀察到的復制時序域直到胚胎有4個細胞時才存在。這意味著與最終身體中的其他細胞不同,DNA在1細胞和2細胞胚胎中是均勻復制的,而不是按順序復制的。每當染色體的一部分展開復制時,DNA區域就會展開,形成一個看起來像岔路口的結構。為了繼續復制,分叉必須沿著DNA鏈向下移動,重新壓縮被復制的區域,并解壓縮下一部分。
研究小組的第二個發現是,在胚胎發生的第1、2和4個細胞階段,分叉的速度比8個細胞階段要慢得多。4細胞胚胎現在可以看作是一個過渡階段,在此期間,統一的DNA復制變得順序,同時仍然表現出1細胞和2細胞胚胎緩慢的叉運動特征。相比之下,8細胞胚胎更類似于成熟細胞,表現出順序復制和快速分叉運動。在受精后的最初幾天里,DNA復制的錯誤經常導致染色體不規則,如額外的拷貝、缺失的拷貝、拷貝斷裂或不完整的拷貝。其中一些復制錯誤會導致流產,而另一些則會導致發育障礙,如唐氏綜合癥,也被稱為21三體。
圖2 小鼠植入早期胚胎的scRepli-seq分析
該團隊的第三個發現是染色體復制錯誤的頻率在早期胚胎中暫時升高,最常見的是在4細胞階段。研究人員再次使用了scRepli-seq,這一次用于檢測染色體拷貝數異常。他們發現,在1細胞和2細胞階段或8細胞和16細胞階段之間的轉變過程中,很少發生錯誤。
另一方面,13%的細胞在4細胞期和8細胞期之間的過渡期間表現出染色體異常,可能是由于4細胞期的復制錯誤。進一步的測試表明,這個階段的復制錯誤與緩慢移動的分叉有關。
“我們的發現引出了許多新的問題,例如,這一系列現象在包括人類胚胎在內的其他物種中是否進化保守? 染色體畸變細胞的后續命運又是怎樣的呢?”
除了指導未來的基礎研究外,這一發現還可以幫助受精診所制定更好的策略,以最大限度地減少受精后最初幾天常見的染色體異常。
參考資料
[1] Embryonic genome instability upon DNA replication timing program emergence
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