是什么決定了小鼠,鱷魚,狗或人的壽命?喬治亞大學(xué)的一組科學(xué)家認(rèn)為,他們對這個(gè)古老的問題有了新的見解。
生態(tài)學(xué)院和薩凡納河生態(tài)實(shí)驗(yàn)室的研究團(tuán)隊(duì)Emily Bertucci和Benjamin B. Parrott提出了一個(gè)強(qiáng)有力的案例,說明其機(jī)理在于基因組與表觀基因組的交集。
揭示衰老的秘密
博士研究生Bertucci和助理教授Parrott以最近發(fā)表的表觀遺傳學(xué)數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),這些數(shù)據(jù)是由于基因表達(dá)修飾而非遺傳密碼改變而引起的生物體變化的基礎(chǔ)。他們最近發(fā)表在《Trends in Genetics》雜志上的文獻(xiàn)綜述指出,表觀遺傳衰老的很大一部分發(fā)生在CpGs區(qū)域。 CpG是位于DNA序列上的特定區(qū)域,其中化學(xué)元素胞嘧啶和鳥嘌呤通過磷酸鍵連接。
文章作者Bertucci說:“ CpG很重要,因?yàn)樵搮^(qū)域會發(fā)生DNA甲基化。甲基化會在DNA鏈上添加一個(gè)化學(xué)密碼,從而賦予該鏈以功能并告訴其如何起作用。它還可以打開或關(guān)閉基因。”
科學(xué)家觀察到甲基化模式隨脊椎動(dòng)物年齡的增長而變化。 “我們知道基因組在某些時(shí)間會發(fā)生某些變化。可以對這些變化進(jìn)行建模以創(chuàng)建表觀遺傳時(shí)鐘。我們可以采集血液樣本進(jìn)行DNA甲基化測序,并準(zhǔn)確預(yù)測年齡。”
Parrott說,在生物的整個(gè)生命周期中,基因組中經(jīng)常發(fā)生雙鏈斷裂。這些斷裂被稱為染色質(zhì)修飾劑的蛋白質(zhì)和酶有效地修復(fù)。根據(jù)這項(xiàng)研究,染色質(zhì)修飾劑離開CpG島修復(fù)斷裂,當(dāng)它們重新定位時(shí),會發(fā)生改變,從而改變基因表達(dá),從而改變細(xì)胞的命運(yùn)。
Bertucci說,如果我們將這些染色質(zhì)修飾劑視為士兵,它們的作用就變得很清楚。他們擁有支持和執(zhí)行土地法規(guī)的獨(dú)特權(quán)力,但是如果他們離開該區(qū)域進(jìn)行救援,那么如果所有這些人都不返回,該區(qū)域就會遭到破壞并變得脆弱。”
多年來,科學(xué)家們已經(jīng)知道,人類,短吻鱷和大象等壽命更長的物種的CpGs水平要高于魚類和嚙齒動(dòng)物等物種。他將島上增加的CpG比作是從燈塔照亮的強(qiáng)光,該燈塔可幫助重新安置的染色質(zhì)修飾劑安全返回家中。當(dāng)修復(fù)雙鏈斷裂時(shí),它們還起到緩沖作用,以保持表觀遺傳景觀的基礎(chǔ)完好。
研究人員稱,在CpGs的密度之外,環(huán)境因素和壓力也可能對壽命起重要作用。
參考資料
Researchers offer insights into aging
Emily M. Bertucci et al. Is CpG Density the Link between Epigenetic Aging and Lifespan?, Trends in Genetics (2020). DOI: 10.1016/j.tig.2020.06.003
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