摘要:環狀RNA ( circular RNA,circRNA )對HCC腫瘤黏附和侵襲的調控作用,是多種細胞過程的重要調節因子,并與癌癥進展密切相關。
轉移尤其是肝內轉移是肝細胞癌( hepatocellular carcinoma,HCC )治療的主要挑戰。細胞骨架重塑已被確定為介導肝內播散的一個重要過程。環狀RNA ( circular RNA,circRNA )對HCC腫瘤黏附和侵襲的調控作用,是多種細胞過程的重要調節因子,并與癌癥進展密切相關。
2023年7月17日,浙江大學蔡秀軍及史亮共同通訊在PNAS 上在線發表題為“Cytoskeleton remodeling mediated by circRNA-YBX1 phase separation suppresses the metastasis of liver cancer”的研究論文,該研究發現了一種核circRNA--circASH2,它在HCC組織中優先丟失,并通過改變腫瘤細胞骨架結構抑制HCC轉移。
肌動蛋白的關鍵結合蛋白原肌球蛋白4 ( TPM4 )被證明是circASH2的主要靶標,并且在轉錄后水平被抑制。這種調控是基于信使RNA ( mRNA ) /前體mRNA的剪接和降解過程。此外,circASH2增強的核Y - box結合蛋白1 ( YBX1 )的液-液相分離增強了TPM4轉錄本的降解。總之,該研究揭示了一種具有腫瘤抑制作用的circRNA,并揭示了HCC進展的精細調節機制。
圖1 研究發現了一種核circRNA--circASH2
肝癌是全球癌癥相關死亡率的第四大原因,而肝細胞癌( hepatocellular carcinoma,HCC )占原發性肝癌的大多數。盡管有全面的治療方案,晚期HCC患者的預后仍然很差。早期肝內轉移,尤其是微小轉移,是HCC治療和改善預后的巨大挑戰。對HCC進展機制的深入了解可能是藥物開發的關鍵。
細胞遷移是腫瘤轉移的關鍵步驟,尤其是上皮來源的腫瘤。在此過程中,細胞骨架的重組和重塑是不可或缺的。哺乳動物細胞骨架是最復雜和功能多樣的結構之一,參與運動、粘附、對外力的反應和細胞形狀的適應等過程。前期研究表明,與細胞外基質( extracellular matrix,ECM )的黏附與HCC轉移密切相關。同時,腫瘤細胞的粘附已被證明是細胞骨架形成和下游信號激活的開始。此外,細胞骨架狀態能夠影響細胞與ECM的相互作用。在細胞骨架蛋白中,原肌球蛋白4 ( TPM4 )是肌動蛋白結合蛋白中的一員,參與非肌細胞的細胞骨架,可以為F - actin提供穩定性,調節其他肌動蛋白結合蛋白。盡管TPM4在多種惡性腫瘤中被報道為癌蛋白,但其上游機制仍不清楚。
前體信使RNA (前信使RNA )剪接是真核生物基因表達的基本過程。在這個過程中,可變剪接是形成表達模式的主要機制,而剪接調控因子如核不均一核糖核蛋白( hnRNPs )和富含絲氨酸/精氨酸的剪接因子對可變剪接起調控作用。此外,許多共調節因子也參與了這一過程。Y盒結合蛋白1 ( YBX1 )是已知的RNA結合蛋白( RBP ),可與hnRNPs形成功能復合物,調控pre - mRNA剪接和mRNA降解。YBX1是一種高度無序的蛋白,中間具有固定的結構,適合與RNA相互作用。有趣的是,固有無序被確定為蛋白質液-液相分離( LLPS )的關鍵特征。
“這是一個驚人的證明,一劑CRISPR-Cas13可能意味著生與死的區別。我們正在以這項研究為基礎,進一步開發改變生活的核酸療法。A*STAR地理信息系統副主任兼首席科學家周偉梁博士說。
圖2 微陣列分析發現circASH2在HCC中具有轉移抑制作用,并受DHX9調節(圖源自PNAS )
活躍的LLPS介導無膜區室的形成,從而時空調控許多關鍵的細胞過程,包括pre - mRNA剪接。LLPS通常由弱的、動態的多價相互作用驅動,與固有無序區域( IDR )和腳手架核酸分子相關。同時,非編碼RNA ( noncoding RNAs,ncRNAs ),如NEAT1和SNHG9,可以與RBPs結合,以濃度或結構依賴的方式誘導LLPS。最近的一項研究也表明,環狀RNA ( circRNA ) VAMP3驅動CAPRIN1的LLPS并促進細胞質中應激顆粒的形成。ncRNAs如何影響LLPS引起了研究者的廣泛關注。但要繪制全貌還需要鑒定更多的功能性RNA。
circRNAs是一種廣泛存在且具有功能的RNA種類。根據其定位和與其他分子的相互作用,circRNAs可以調節轉錄和剪接,調節mRNA的穩定性和翻譯,影響蛋白質的功能和代謝,甚至在不同的生物學和病理生理條件下直接作為翻譯模板。在腫瘤研究中,越來越多的證據表明circRNA在腫瘤的發生和發展中發揮著重要作用。然而,circRNA在臨床上的應用還有待進一步研究。
該研究對人類HCC樣本中的circRNomics進行了深入分析,并確定了環狀RNA ASH2 ( circRNA )是一種具有轉移抑制作用的circRNA。circASH2破壞腫瘤細胞骨架,減弱細胞粘附。臨床上,circASH2表達下調提示HCC患者預后更差。機制上,circ ASH2誘導YBX1的LLPS,進而調控hnRNPs / YBX1復合物。通過這種方式靶向TPM4轉錄本并特異性促進其降解。總之,該研究證實了TPM4相關的細胞骨架/腫瘤粘附通路抑制了HCC的進展。
參考資料:
[1] Cytoskeleton remodeling mediated by circRNA-YBX1 phase separation suppresses the metastasis of liver cancer.
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