摘要:研究人員利用人工智能(AI)模擬病毒的復(fù)雜結(jié)構(gòu),開(kāi)發(fā)出了一種創(chuàng)新的治療平臺(tái)。
美國(guó)華盛頓大學(xué)的2024年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)得主David Baker教授,與浦項(xiàng)工科大學(xué)化學(xué)工程系的Sangmin Lee教授合作,利用人工智能(AI)模擬病毒的復(fù)雜結(jié)構(gòu),開(kāi)發(fā)出了一種創(chuàng)新的治療平臺(tái)。他們的開(kāi)創(chuàng)性研究成果發(fā)表在了當(dāng)?shù)貢r(shí)間18日出版的《自然》雜志上。
病毒的獨(dú)特設(shè)計(jì)是將遺傳物質(zhì)封裝在球形蛋白質(zhì)外殼內(nèi),使它們能夠復(fù)制和侵入宿主細(xì)胞,經(jīng)常引起疾病。受這些復(fù)雜結(jié)構(gòu)的啟發(fā),研究人員一直在探索以病毒為模型的人工蛋白質(zhì)。這些“nanocages(納米籠”模擬病毒行為,有效地將治療基因傳遞給目標(biāo)細(xì)胞。然而,現(xiàn)有的納米籠面臨著重大的挑戰(zhàn):它們的小尺寸限制了它們可以攜帶的遺傳物質(zhì)的數(shù)量,而且它們簡(jiǎn)單的設(shè)計(jì)無(wú)法復(fù)制天然病毒蛋白質(zhì)的多功能性。
圖1 通過(guò)程序化對(duì)稱破缺設(shè)計(jì)的四組分蛋白質(zhì)納米籠
為了解決這些限制,研究團(tuán)隊(duì)使用了人工智能驅(qū)動(dòng)的計(jì)算設(shè)計(jì)。雖然大多數(shù)病毒顯示對(duì)稱結(jié)構(gòu),但它們也具有微妙的不對(duì)稱性。利用人工智能,該團(tuán)隊(duì)重現(xiàn)了這些細(xì)微的特征,并首次成功地設(shè)計(jì)了四面體、八面體和二十面體形狀的納米籠。
由此產(chǎn)生的納米結(jié)構(gòu)由四種類型的人工蛋白質(zhì)組成,形成具有六種不同蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)界面的復(fù)雜結(jié)構(gòu)。其中,直徑達(dá)75納米的二十面體結(jié)構(gòu)比腺相關(guān)病毒(AAV)等傳統(tǒng)基因傳遞載體能夠容納三倍多的遺傳物質(zhì),這標(biāo)志著基因治療的重大進(jìn)步。
電子顯微鏡證實(shí),人工智能設(shè)計(jì)的納米籠達(dá)到了預(yù)期的精確對(duì)稱結(jié)構(gòu)。功能實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明了它們能夠有效地將治療有效載荷輸送到靶細(xì)胞,為實(shí)際醫(yī)學(xué)應(yīng)用鋪平了道路。
圖2 設(shè)計(jì)策略概述
Lee教授表示:“隨著人工智能的發(fā)展,可以根據(jù)人類的需要設(shè)計(jì)和組裝人工蛋白質(zhì),從而開(kāi)啟了新時(shí)代。我們希望這項(xiàng)研究不僅能加速基因療法的發(fā)展,還能推動(dòng)下一代疫苗和其他生物醫(yī)學(xué)創(chuàng)新的突破。”
這項(xiàng)研究得到了韓國(guó)科學(xué)和信息通信技術(shù)部杰出青年科學(xué)家計(jì)劃、納米和材料技術(shù)發(fā)展計(jì)劃以及全球前沿研究計(jì)劃的支持,美國(guó)霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所(HHMI)提供了額外的資金。
參考資料
[1] Four-component protein nanocages designed by programmed symmetry breaking