LudgerTag™ 2-AA(2-氨基苯甲酸)多糖標(biāo)記試劑盒(貨號(hào):LT-KAA-A2)包含經(jīng)胺化還原反應(yīng)使染料結(jié)合在多糖未結(jié)合還原端基的試劑,使用2-氨基苯甲酸(2-AA)標(biāo)記未結(jié)合多糖。
應(yīng)用:用2-氨基苯甲酸(2-AA)標(biāo)記未結(jié)合多糖
染料性質(zhì)
分子量 137
熒光 λex(染料) = 320 nm, λex(多糖結(jié)合染料) = 360 nm,λem = 420 nm
*我們建議激發(fā)波長為360納米,以獲得大的檢測(cè)靈敏度
結(jié)構(gòu)
樣品數(shù):通常每套標(biāo)記試劑較佳情況下可分析15個(gè)獨(dú)立樣品。
樣品量:每個(gè)樣品含25pmol到25nmol多糖。
適合檢測(cè)的樣品:帶有未結(jié)合還原末端的純化聚糖,都可以進(jìn)行標(biāo)記。
結(jié)構(gòu)完整性:未發(fā)現(xiàn)唾液酸、
巖藻糖、硫酸鹽或磷酸鹽的損失(<2摩爾百分比)。
標(biāo)記效率:通常大于85%(取決于樣品)。
標(biāo)記選擇性:本質(zhì)上是化學(xué)計(jì)量標(biāo)記。
儲(chǔ)存:室溫下暗處儲(chǔ)存。遠(yuǎn)離熱源、避光和防潮。所供試劑至少可穩(wěn)定保存兩年。
運(yùn)輸:該產(chǎn)品可在室溫下運(yùn)輸。
處置:使用時(shí)涉及的玻璃或塑料器皿以及溶劑,應(yīng)確保不含糖化酶及外源性碳水化合物。在所有樣品處理時(shí),使用無粉末手套,避免受到外源性碳水化合物的污染。標(biāo)記試劑設(shè)計(jì)的所有步驟都必須在干燥環(huán)境下操作,并使用干燥的玻璃和塑料器皿。一旦打開試劑瓶,應(yīng)立即使用。多余試劑根據(jù)當(dāng)?shù)匕踩?guī)則丟棄。
安全:僅供研究用。不得用于人體或藥用。請(qǐng)閱讀安全數(shù)據(jù)表(SDS)了解所有相關(guān)化學(xué)品。標(biāo)記試劑涉及的操作,都應(yīng)配備使用適當(dāng)?shù)膫€(gè)人安全保護(hù)裝置 - 眼鏡、耐化學(xué)性手套(如 腈類手套),以及在實(shí)驗(yàn)室通風(fēng)柜進(jìn)行操作。
試劑盒組成
每個(gè)標(biāo)記試劑盒包括1瓶以下試劑:
Cat. |
# Item |
Quantity |
LT-2AA-01 |
2-AA染料 (2-氨基苯甲酸) |
5 mg |
LT-DMSO-01 |
二甲基亞砜 DMSO |
350 μl |
LT-ACETIC-01 |
冰醋酸 |
500 μL |
LT-CYANOB-01 |
氰基硼氫化鈉(還原劑) |
6 mg |
所需的其他試劑和設(shè)備
- 加熱模塊、爐或相近功能的干熱器(不能使用水?。?,設(shè)定在65°C
- 旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(例如Savant, Heto, 或其它)
- 反應(yīng)小瓶 (e.g. 聚丙烯 微量離心瓶)
- 注:如果進(jìn)行樣品標(biāo)記后洗滌(參見樣品洗滌部分),則需要其它試劑。
標(biāo)記操作時(shí)間線
LudgerTag 標(biāo)記過程,加上可選樣品標(biāo)記后洗滌,通常需要4-5個(gè)小時(shí):
過程 |
時(shí)間 |
總時(shí)間(小時(shí)) |
樣品轉(zhuǎn)移到反應(yīng)瓶并干燥 |
30分鐘 |
0.5 |
配置并加入標(biāo)記試劑 |
15分鐘 |
0.75 |
樣品和試劑一起培養(yǎng) |
3 小時(shí) |
3.75 |
標(biāo)記后洗滌 |
1小時(shí) |
4.75 |
還原性胺化
標(biāo)記反應(yīng)涉及一個(gè)兩步反應(yīng)過程。 (見圖1):
1.希夫堿生成
具有未結(jié)合還原末端的多糖,其末端在閉環(huán)(有環(huán))和開環(huán)(無環(huán))狀態(tài)之間處于平衡狀態(tài)。染料的伯胺對(duì)無環(huán)還原端基殘基的羰基碳進(jìn)行親核進(jìn)攻,形成部分穩(wěn)定的席夫堿。
2. 希夫堿還原
希夫堿亞胺基通過化學(xué)還原生成穩(wěn)定標(biāo)記的多糖。
圖1:通過還原性胺化反應(yīng),用2-氨基苯甲酸標(biāo)記多糖
標(biāo)記操作概述
LudgerTag 多糖標(biāo)記試劑盒,用于熒光或發(fā)色標(biāo)記帶有為結(jié)合還原端基的多糖。在所中色譜和結(jié)構(gòu)序列分析中,經(jīng)標(biāo)記的多糖既可以進(jìn)行高靈敏度熒光檢測(cè),也可以進(jìn)行紫外吸收監(jiān)測(cè),包括使用LudgerSep液相色譜柱的色譜分析和使用外切糖苷酶的序列分析(參見 參考1-5, 7)。
標(biāo)記過程概述如下:
1 多糖準(zhǔn)備
準(zhǔn)備多糖樣品,去除類似鹽和洗滌劑等可能干擾標(biāo)記過程的污染物。
2 多糖干燥
將樣品置于反應(yīng)小瓶中干燥。
3 標(biāo)記試劑準(zhǔn)備
將試劑盒中相關(guān)試劑混合制備新鮮的染料標(biāo)記溶液。
4 將標(biāo)記試劑加入多糖中
將小量的標(biāo)記溶液加入每一份多糖樣品中
5 培養(yǎng)
培養(yǎng)樣品使標(biāo)記反應(yīng)進(jìn)行下去。
6 標(biāo)記后洗滌
培養(yǎng)完成后,如有必要(根據(jù)后續(xù)分析過程而定),直接進(jìn)入洗滌流程以去除過量的標(biāo)記試劑。.
7 經(jīng)標(biāo)記的多糖儲(chǔ)存或者分析
經(jīng)標(biāo)記的多糖樣品現(xiàn)在可以用于分析了。
樣品準(zhǔn)備
要進(jìn)行標(biāo)記的多糖樣品,無論是純化的或是多糖混合物,必須包含未結(jié)合的還原端基,顆粒狀且不含無機(jī)鹽,并溶于易揮發(fā)的溶劑體系中(建議是純水)。
下列物質(zhì)可能干擾標(biāo)記反應(yīng),必須在進(jìn)行LudgerTag™ 標(biāo)記之前,事先從多糖樣品中去除:
不揮發(fā)溶劑
不揮發(fā)鹽,尤其是過渡金屬離子
洗滌劑
染料和染色劑,例如考馬斯藍(lán)
Ludger提供了一系列LudgerClean™試劑盒,用于在Ludgertag™標(biāo)記之前洗滌多糖樣品。這些內(nèi)容在LudgerClean多糖洗滌指南[參考6]中有詳細(xì)說明。
標(biāo)準(zhǔn)樣品制備概述如下:
1 多糖純化
如有必要,從樣品中按照多糖洗滌指南[參考6]中所述去除非碳水化合物污染物。
2 將樣品轉(zhuǎn)移至反應(yīng)小瓶中
從典型糖蛋白中獲得的多糖,樣品量應(yīng)在100個(gè)皮摩爾-50納米摩爾的范圍內(nèi)。單一的純多糖,即使僅有5皮摩爾的量,也可以被標(biāo)記,并在之后高效液相色譜分析中檢測(cè)出。適用的反應(yīng)小瓶,包括小型聚丙烯微離心管和可用于PCR操作的試管。
3 樣品干燥
理論上,應(yīng)使用旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)器干燥樣品。如果條件不允許,可以小心使用冷凍干燥(尤其要確保在小瓶的底部的樣品,凍干成小而致密的物質(zhì))。 不要將樣品置于高溫(>28℃)或極端pH環(huán)境下,因?yàn)檫@樣會(huì)導(dǎo)致唾液酸在酸催化下耗損(高溫、強(qiáng)酸),或多糖還原端的異構(gòu)反應(yīng)(強(qiáng)堿)。
標(biāo)記試劑準(zhǔn)備
按如下過程制備新鮮標(biāo)記試劑:
4 制備DMSO-醋酸混合液
150μl冰醋酸加入盛有DMSO的小瓶中,并用移液器抽吸混合。
冰醋酸和DMSO的貨號(hào)分別為LT-ACETIC-01和 LT-DMSO-01。
小心敲擊安瓿瓶以震落附著安瓿上半部的內(nèi)容物,然后小心打開安瓿瓶。
如果DMSO凍成固體,在烘箱或加熱快上在30-65℃之間緩慢加熱小瓶(在啟封前)。
5 加入染料
將100μl DMSO-醋酸混合液加入LudgerTag™ 2-AA (2-氨基苯甲酸) 染料小瓶中,混合直至染料全部溶解。
染料貨號(hào)為LT-2AA-01。
6 加入還原劑
將溶解的染料加入盛有LudgerTag™ 氰基硼氫化鈉 (還原劑) 的小瓶中,使用移液器抽吸混合直至還原劑全部溶解形成最終的標(biāo)記試劑。
氰基硼氫化鈉還原劑的貨號(hào)是LT-CYANOB-01。
如果還原劑難以溶解,那么在65℃的恒溫培養(yǎng)箱中,或者加熱塊上,輕緩地加熱至多4分鐘。如還原劑仍未全溶,補(bǔ)加10μl純水并混合均勻。
標(biāo)記試劑應(yīng)防潮,并在配置60分鐘內(nèi)使用。
標(biāo)記反應(yīng)
7 將標(biāo)記試劑加入樣品
將5μl標(biāo)記試劑加入到每一份經(jīng)干燥的多糖樣品中,蓋上離心管,徹底混合,然后輕輕敲擊以確保標(biāo)記溶液位于小瓶的底部。
8 培養(yǎng)
將反應(yīng)小瓶放在65℃的加熱塊、砂浴或烘箱中,培養(yǎng)3小時(shí)。
培養(yǎng)必須在干燥的環(huán)境下進(jìn)行。請(qǐng)使用培養(yǎng)箱或干燥塊,請(qǐng)務(wù)必不要使用水浴。
樣品必須全部溶解在標(biāo)記溶液中,才能有效進(jìn)行標(biāo)記。為了促進(jìn)全部溶解,樣品可在培養(yǎng)溫度達(dá)到65℃后渦旋混合30分鐘,然后繼續(xù)培養(yǎng)。
在大多數(shù)情況下,培養(yǎng)時(shí)間可以縮短至2小時(shí)或延長至4小時(shí),而不會(huì)顯著改變標(biāo)記反應(yīng)結(jié)果。
9 離心并冷卻
培養(yǎng)結(jié)束后取出樣品,短暫離心微量試管,并讓其全部冷卻至室溫。
LudgerClean™ S 標(biāo)記后樣品洗滌
對(duì)于特定的應(yīng)用 - 例如后續(xù)的HPLC分析,標(biāo)記后的樣品洗滌(去除多余的染料和其它標(biāo)記試劑) 是必不可少的。使用LudgerClean™ S 小柱 (貨號(hào) LC-S-Ax, 此處x代表試劑盒中小柱的數(shù)量)按試劑盒所附標(biāo)準(zhǔn)操作程序可以完成樣品洗滌。
對(duì)于過量標(biāo)記試劑不會(huì)影響后續(xù)樣品分析的應(yīng)用而言,樣品標(biāo)記后洗滌并非必需。這些分析手段包括碳水化合物電泳,游離染料會(huì)從標(biāo)記多糖條帶處分離開。
LudgerTag™ 2AA標(biāo)記多糖的分析
LudgerTag™ 2-AA標(biāo)記多糖可通過一系列分析方法進(jìn)行研究,包括HPLC,凝膠電泳和質(zhì)譜。 這些會(huì)在參考資料8里詳細(xì)敘述,在下文也有概述。
高壓液相色譜分析
LudgerTag™ 2-AA標(biāo)記多糖混合物可以通過一系列HPLC(高壓液相色譜)方法進(jìn)行分離和分析,也包括LudgerSep HPLC:
分析類型
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柱子
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貨號(hào)
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帶電荷和中性多糖的分離
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LudgerSep™ C
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LS-C-01
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帶電荷和中性多糖的剖面分析
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LudgerSep™ N
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LS-N-01
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中性多糖的分離
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LudgerSep™ R
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LS-R-01
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上述多糖分析柱的使用在參考4和參考8里有概述。
對(duì)于從復(fù)雜多糖混合物中純化和分析LudgerTag?標(biāo)記寡糖而言,LudgerSep N柱是很有效的分析工具。
關(guān)于您的特殊應(yīng)用,請(qǐng)聯(lián)系我們獲取建議。
酶法分析
高純度,測(cè)序級(jí)酶(例如外切糖苷酶),適合N-和O-鏈接LudgerTag™ 標(biāo)記多糖的結(jié)構(gòu)分析,許多公司有市售產(chǎn)品。
選擇糖苷酶時(shí),尤其應(yīng)注意選擇配方與您專屬應(yīng)用匹配的產(chǎn)品。例如,部分酶和緩沖液擁有會(huì)干擾特定分析手段的組份。在選則您工作所需的酶和反應(yīng)條件時(shí),請(qǐng)致電我們獲取指導(dǎo)。
質(zhì)譜和電泳
LudgerTag™ 標(biāo)記多糖也可以用質(zhì)譜、電泳和其它光譜分析手段進(jìn)行分析。如果您想確定合適的分析條件,請(qǐng)來電咨詢。
參考文獻(xiàn)及相關(guān)文獻(xiàn)
1 Bigge, J.C.; Patel, T.P; Bruce, J.A.; Goulding, P.N.; Charles, S.M; Parekh, R.B. (1995) 'Non-selective and efficient fluorescent labeling of glycans using 2-aminobenzamide and anthranilic acid'. Analytical Biochemistry 230: 229-238
2 Guile, G.R.; Rudd, P.M.; Wing, D.R.; Prime, S.B.; Dwek, R.A. (1996) 'A rapid and high-resolution high-performance liquid chromatographic method for separating glycan mixtures and analyzing oligosaccharide profiles'. Analytical Biochemistry 240: 210-226
3 Townsend, R.R.; Lipniunas, P.H.; Bigge, C.; Ventom, A.; Parekh, R. (1996) 'Multimode high-performance liquid chromatography of fluorescently labeled oligosaccharides from glycoproteins'.Analytical Biochemistry 239: 200-207
4 LudgerSep High Resolution HPLC Carbohydrate Profiling Guide (Cat # LS-GUIDE-01)
5 Ludger Enzyme Selection Guide (Cat # EZ-GUIDE-01)
6 LudgerClean Glycan Cleanup Guide (Cat # LC-GUIDE-01)
7 Hardy, M.R. (1997)‘Glycan labeling with the fluorophores 2-aminobenzamide and anthranilic acid’in ‘Techniques in Glycobiology’, edited by Townsend, R.R and Hotchkiss, A.T.. Marcel Dekker Inc, New York .
8 Ludger Technical Note # TN-AA-01: Analysis of 2-AA (2-aminobenzoic acid) labeled glycans
故障排除
Ludgertag™標(biāo)記過程是一種有效、可靠的方法。如果出現(xiàn)問題,通常可以毫無毫不費(fèi)力地予以糾正。以下是有可能出現(xiàn)的問題、可能的原因和解決方案。
染料結(jié)合率低 / 標(biāo)記收率低
標(biāo)記溫度不正確
請(qǐng)確保烘箱或加熱塊預(yù)設(shè)與培養(yǎng)溫度相稱,并確保反應(yīng)管在標(biāo)記時(shí)始終處于該溫度下。
樣品未全部溶解
多糖必須全部溶解在標(biāo)記混合溶液中,標(biāo)記效率才能放大化。
請(qǐng)確保在培養(yǎng)操作之前,樣品與標(biāo)記試劑全部混合均勻。作為預(yù)防措施,在培養(yǎng)開始后,繼續(xù)仔細(xì)攪拌樣品15分鐘。
樣品中含有干擾標(biāo)記的污染物。
在標(biāo)記之前,請(qǐng)確認(rèn)多糖得到足夠純化(參見操作步驟1和 LudgerClean™ 多糖洗滌指南)
標(biāo)記溶液無效。
請(qǐng)務(wù)必在使用前即刻配置標(biāo)記溶液 - 試劑在混合后的幾小時(shí)內(nèi)即會(huì)失活。
啟動(dòng)時(shí)多糖較原先預(yù)估的要少
多糖不含未結(jié)合的還原基團(tuán)。
2-AA染料通過未結(jié)合的還原端的醛基與多糖結(jié)合。糖醇和還原端基已經(jīng)結(jié)合的多糖 (例如糖肽,糖脂和已標(biāo)記多糖)不含未結(jié)合還原端基,因此無法和染料結(jié)合。
在標(biāo)記后洗滌時(shí)多糖損耗。
請(qǐng)確認(rèn)已經(jīng)按照洗滌規(guī)程去除多余標(biāo)記試劑,且洗滌試劑正確配制。
標(biāo)記樣品中含有帶熒光的非碳水化合物
原始的多糖中含有醛穩(wěn)定污染物。
請(qǐng)確認(rèn)多糖在標(biāo)記前已經(jīng)足夠純化(參見操作步驟1和LudgerClean多糖洗滌指南)。
標(biāo)記后洗滌步驟未正常工作
請(qǐng)確認(rèn)已經(jīng)按照洗滌規(guī)程去除多余標(biāo)記試劑,且洗滌試劑正確配制。
較小分子量多糖選擇性損耗
洗滌小柱未正確填充
請(qǐng)確保小柱已經(jīng)正確充填,樣品上盤時(shí),柱床已經(jīng)用乙腈浸潤。
標(biāo)記后洗滌時(shí)是否使用了不當(dāng)清洗劑。
請(qǐng)確保清洗劑正確配制。
較大分子量多糖選擇性損耗
樣品未全部溶解
多糖必須全部溶解于標(biāo)記混合物中以獲得較大標(biāo)記效率。 較大的多糖較小分子糖更難溶于標(biāo)記混合物中。請(qǐng)確保樣品在培養(yǎng)前與標(biāo)記試劑混合均勻,可以在培養(yǎng)開始后再小心混合樣品15分鐘,以作為預(yù)防措施。
多糖去唾液酸化
樣品在高溫下水溶液中呈酸性。
避免唾液酸化多糖樣品溶液長時(shí)間處于酸性和高溫環(huán)境下。注意還原胺化反應(yīng)是在無水條件下進(jìn)行的,在此條件下唾液酸的損失較小。
通常,樣品保存在5-8.5的溶液中,避免暴露在30℃以上的溫度下。樣品溶于pH緩沖溶液(pH介于5和8.5之間),即使在高于30℃的溫度下,也往往能夠抵抗酸催化的去唾液酸反應(yīng)。即使這樣,也要謹(jǐn)慎行事,盡可能保持樣品冷卻。
樣品標(biāo)記后沒有正確洗滌
確保樣品在還原胺化反應(yīng)后立即進(jìn)行標(biāo)記后洗滌,且標(biāo)記后的干燥和洗滌應(yīng)金肯能快地進(jìn)行。
未經(jīng)干燥和隨后洗滌的標(biāo)記樣品容易發(fā)生酸催化去唾液酸反應(yīng)。
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